Dziś cajon jest instrumentem szeroko stosowanym na Kubie oraz wybrzeżu Peruwiańskim. Wykorzystuje się go w takich stylach muzycznych jak Tondero, Zamacueca, Waltz peruwiański, Flamenko czy Rumba. Nowoczesny cajon często stosowany jest w towarzystwie gitary akustycznej, doskonale komponując się z jej brzmieniem. Stał się on szybko popularny w takich gatunkach muzycznych jak blues, rock, pop, funk, world music, fusion, a także jazz.
Cajon ma także swoje niestandardowe zastosowanie. Wykorzystuje się go do gry na rozmaite sposoby. Dzieje się tak dlatego, że jest instrumentem perkusyjnym, lecz przeznaczonym dla wszystkich muzyków, a nie tylko perkusistów. Standardowo gra się na nim rękoma, ale można również wykorzystywać przedmioty czy tworzywa sztuczne, jak choćby metalowe szczotki, które zwykle stosuje się w bębnach. Można wydobywać dźwięk z cajon’a także za pomocą zwykłego pedału bębna basowego, identycznego jak ten, który spotykany jest w zestawie perkusyjnym. Niezwykły sposób na grę na cajonie wynalazł włoski perkusista Ovidio Venturoso. W lutym 2008 roku przedstawił i opatentował urządzenie, które pozwala na granie na cajonie zarówno rękami i pedałem bez zmiany pozycji standardowej.
